IICAR-Omics: La Plataforma de Genómica y Bioinformática creada para brindar soporte en el análisis bioinformático de ácidos nucleicos y proteínas.
En el año 2021 se creó la Plataforma de Genómica y Bioinformática
(IICAR-Omics), con el objetivo de brindar soporte especializado en el análisis bioinformático de ácidos nucleicos y proteínas, facilitando el procesamiento e interpretación de datos biológicos mediante herramientas computacionales de última generación.
Actualmente, la plataforma cuenta además con capacidad para realizar secuenciación utilizando tecnología Oxford Nanopore (ONT).
La Plataforma IICAR-Omics no solo apoya a los investigadores del sistema científico-tecnológico, sino que también ofrece servicios de secuenciación y consultoría a instituciones privadas. Asimismo, mantiene convenios y desarrolla colaboraciones con instituciones científicas tanto a nivel nacional como internacional.
Equipo de trabajo
El equipo posee amplia experiencia en el análisis computacional de datos derivados de tecnologías de secuenciación masiva
(Next Generation Sequencing, NGS), incluyendo estudios de expresión génica, identificación de variantes, análisis de regulación génica, genómica comparativa, ensamblaje de genomas, así como la visualización e interpretación integral de datos genómicos.
Dra. Maricel Podio – Investigadora Adjunta CONICET.
Dr. Gustavo Rodríguez – Investigador Principal CONICET.
Dr. Juan Pablo A. Ortiz – Investigador Principal CONICET.
Dra. Lorena Siena – Investigadora Adjunta CONICET.
Dr. Paolo Cacchiarelli – PhD Profesor FCA-UNR.
Dra. Dana Vázquez – PhD Investigadora CIUNR.
Dr. Vladimir Cambiaso – PhD Investigador Asistente CONICET.
Lic. Juan Manuel Vega – Lic. RRNN Becario Doctoral CONICET.
Principales Capacidades de la Plataforma
Secuenciación de ADN y ARN mediante tecnología ONT.
Análisis de secuencias generadas por plataformas Illumina.
Análisis de expresión génica diferencial mediante RNA-seq.
Estudios de metilación por ddRAD (MCSeEd).
Alineamiento y comparación de genomas completos.
Identificación de variantes génicas y alélicas.
Ensamblado de genomas y transcriptomas (de novo y/o basado en referencia).
Desarrollo de marcadores moleculares a partir de datos de secuenciación.
Procesamiento de datos provenientes de plataformas de genotipado masivo (SNP arrays, GBS, entre otras).
Análisis QTL-seq, combinando el estudio de poblaciones segregantes con secuenciación genómica.
Contactanos
La Plataforma IICAR-Omics participa activamente en la formación de recursos humanos de posgrado, contribuyendo a la capacitación de becarios/as doctorales y posdoctorales en el uso de tecnologías de secuenciación y herramientas bioinformáticas avanzadas. En este contexto, la plataforma brinda apoyo en el diseño experimental, el procesamiento y análisis de datos, así como en la interpretación de resultados, favoreciendo el desarrollo de competencias en genómica y bioinformática aplicadas a las ciencias agrarias.
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